คุณสมบัติของผู้เข้ารับการฝึกอบรม
1. เป็นผู้ได้รับวุฒิบัตรแสดงความรู้ความชำนาญในการประกอบวิชาชีพเวชกรรม หรือหนังสืออนุมัติแสดงความรู้ความชำนาญในการประกอบวิชาชีพเวชกรรม

สาขาอายุรศาสตร์ หรือสาขาศัลยศาสตร์ หรือเวชบำบัดวิกฤตของแพทยสภา
2. มีคุณสมบัติครบถ้วนตามเกณฑ์แพทยสภาในการเข้ารับการฝึกอบรมแพทย์เฉพาะทาง

เกณฑ์การคัดเลือก
1. พิจารณารับแพทย์ประจำบ้านต่อยอดอนุสาขาโภชนศาสตร์คลินิก ตามจำนวนที่หลักสูตรกำหนด (ตามโควตาของแพทยสภา)
2. ผู้สมัครต้องมีคุณสมบัติถูกต้อง ครบถ้วนตามระเบียบของสมาคมผู้ให้อาหารทางหลอดเลือดดำและ ทางเดินอาหารแห่งประเทศไทย แพทยสภา และราชวิทยาลัยอายุรแพทย์
3. พิจารณารับแพทย์ประจำบ้านต่อยอดที่มีต้นสังกัดมากกว่าแพทย์ประจำบ้านต่อยอด

ต้นสังกัดอิสระ
4. การตัดสินแพทย์ประจำบ้านต่อยอดอนุสาขาโภชนศาสตร์คลินิก พิจารณาจากคะแนนรวมด้านต่าง ๆ

นโยบายการคัดเลือก
เพื่อให้เป็นไปตามมาตรฐานสากลและการพัฒนาคุณภาพสถาบันการฝึกอบรม

หน่วยโภชนศาสตร์คลินิกจึงเปิดรับแพทย์ประจำบ้านต่อยอดทุกเพศ ทุกวัฒนธรรม และทุกศาสนา ทั้งนี้ภายใต้การเรียนการสอนของโรงพยาบาลพระมงกุฎเกล้า

สถาบันมีความพร้อมในการรับผู้เข้าฝึกอบรมที่มีความหลากหลายและสามารถสร้าง

การเรียนรู้การปฏิสัมพันธ์อย่างเหมาะสมภายใต้ความหลากหลายดังกล่าว
อีกทั้งหน่วยโภชนศาสตร์คลินิก ไม่มีนโยบายกีดกันผู้เข้ารับฝึกอบรมที่มีความพิการซึ่งต้องการความช่วยเหลือเป็นพิเศษ เว้นแต่คณะกรรมการสอบคัดเลือกแพทย์ประจำบ้านต่อยอดอนุสาขาโภชนศาสตร์คลินิก พิจารณาแล้วเห็นว่าความพิการนั้นเป็นอุปสรรคต่อการฝึกอบรม การปฏิบัติหน้าที่ และอาจเป็นอันตรายต่อผู้ป่วย